Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms