Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GabpaQ00422 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GabpaQ00422 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms