Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psmb4P99026 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms