Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms