Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smn1P97801 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms