Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cbx1P83917 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cbx1P83917 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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