Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gabpb2P81069 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms