Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr1bP70700 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr1bP70700 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1bP70700 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1bP70700 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1bP70700 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1bP70700 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1bP70700 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1bP70700 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1bP70700 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms