Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp9xP70398 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp9xP70398 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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