Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SeboxP70368 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms