Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb13P70321 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb13P70321 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms