Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf6P70196 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf6P70196 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms