Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubb4bP68372 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubb4bP68372 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms