Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crnkl1P63154 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms