Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrb3P63080 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms