Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UbdP63072 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UbdP63072 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UbdP63072 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms