Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrpd1P62315 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms