Protein–RNA interactions for Protein: P61294

Rab6b, Ras-related protein Rab-6B, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6bP61294 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab6bP61294 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab6bP61294 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms