Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Tmem258P61166 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms