Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sem1P60897 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sem1P60897 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sem1P60897 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sem1P60897 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sem1P60897 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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