Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Eif3eP60229 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Eif3eP60229 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms