Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhbdl3P58873 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms