Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tubgcp3P58854 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubgcp3P58854 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubgcp3P58854 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms