Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm2P58774 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms