Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Paxbp1P58501 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Paxbp1P58501 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms