Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NcstnP57716 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NcstnP57716 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms