Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gp1bbP56400 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms