Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp5P56399 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms