Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lbx1P52955 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lbx1P52955 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lbx1P52955 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lbx1P52955 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lbx1P52955 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lbx1P52955 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lbx1P52955 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lbx1P52955 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lbx1P52955 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lbx1P52955 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms