Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fgd1P52734 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fgd1P52734 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms