Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnfP51944 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnfP51944 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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