Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apobec1P51908 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms