Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms