Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa-rs12P50716 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa-rs12P50716 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms