Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Defa8P50706 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa8P50706 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms