Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TubP50586 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TubP50586 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TubP50586 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TubP50586 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TubP50586 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TubP50586 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TubP50586 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TubP50586 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TubP50586 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TubP50586 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms