Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cav1P49817 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cav1P49817 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms