Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms