Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VdrP48281 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VdrP48281 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VdrP48281 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VdrP48281 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VdrP48281 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms