Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gbx2P48031 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gbx2P48031 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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