Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scg3P47867 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scg3P47867 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms