Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tlx1P43345 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms