Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tnfsf9P41274 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tnfsf9P41274 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfsf9P41274 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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