Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbP41155 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms