Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TfamP40630 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TfamP40630 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TfamP40630 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms