Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps26aP40336 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps26aP40336 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms