Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd9P40240 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd9P40240 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms