Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csf3rP40223 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3rP40223 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3rP40223 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3rP40223 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csf3rP40223 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csf3rP40223 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Csf3rP40223 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Csf3rP40223 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csf3rP40223 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms