Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgclP38060 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmgclP38060 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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