Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lig1P37913 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig1P37913 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lig1P37913 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms